Angående virus!

BESKRIV DE ALLMÄNNA EGENSKAPERNA HOS VIRUS?
Skillnaden mellan bakterier och virus är att virus inte är en egentlig organism. Man skulle kunna beskriva virus som en bit DNA eller RNA som vill föras vidare och som gör det genom att parasitera på andra organsimer och deras ämnesomsättning och proteinsyntes. Med andra ord : virus ”kidnappar” värdcellens system. Virus kan angripa antingen däggdjursceller eller bakterier. I det senare falllet kallas virus ofta för ”bakteriofager”. Då virus angriper djur är de oftast art-specifika. Undantag finns; HIV spreds exempelvis från apor till människor.

BESKRIV INFEKTIONSFÖRLOPPET FÖR VIRUS!
Virus tillämpar två huvudsakliga strategier när det gäller att invardera sin värdcell; antingen lysogen fas eller lytisk fas!
Den ena strategin = lytisk fas, innebär att viruset börjar kopiera sin egen arvsmassa samt nya virusproteinert direkt då den kommer in i cellen. De nya viruspartiklarna lämnar sedan cellen. Då det är värdcellens eget byggmaterial som används förlorar denna mycket energi under processen. Då de nya viruspartiklarna sedan lämnar värdcellen så dör den senare oftast.

VILKEN TYP AV VIRUS BRUKAR TILLÄMPA DENNA STRATEGI?
Bakteriofager framför allt. De kallas då virulenta fager. Strategin ger snabb spridning, så länge det finns tillgängliga värdceller i närheten. Då viruset förstört samtliga måste de nya viruspartiklarna ge sig ut på resa för att hitta nya värdceller. Under denna resa kan viruset ofta dö ut.

BESKRIV STRATEGI 2!
Viruset inkorporerar sitt eget DNA i värdcellens DNA. Där kan viruset ligga och vila samt föras vidare genom varje celldelning under hundratals generationer; fram tills dess att värdcellen utsätts för någon form av stress; t.ex UV-ljus. Då kommer viruset lämna det sjunkande skeppet genom att plötsligt gå in i lytisk fas.

BESKRIV DE TRE OLIKA STRATEGIERNA OCH TYPERNA AV ANIMALA VIRUS!
DNA – virus : kopierars först. Sen utvecklas det i cellkärnan hos värdcellen. Sedan slår det ut cellens egna DNA. Då märker man av infektionen.
RNA-virus : kopieras och utvecklas i cellkärnan.
RETRO-VIRUS : Retrovirus invaderar cellen som RNA, bildar en DNA-kopia med hjälp av enzymet reverse transcriptase och denna DNA-kopia byggs in i cellens kromosomala DNA.

BESKRIV FAG λ : S INFEKTIONSFÖRLOPP!
Fag λ är en temperat fag, det vill säga : den dödar vanligen inte sin värdcell. Ett temperat virus kan alltså ”välja” huruvida det ”vill” utnyttja värdcellen lytiskt eller lysogent.
Vilken strategi som fagen väljer avgörs genom en ”tävling” mellan operonen på fagens DNA.
Fag λ innehåller nämligen en dubbelpromotor med sekvenser som kan locka till sig RNApolymeras som därefter tillverkar antingen Cro-proteinet + andra proteiner som behövs för lytisk fas eller ett repressorprotein + andra proteiner som behövs för lysogen fas. Cro och repressorn fungerar dessutom som repressorer för varandras operon! En slumpgenerator favoriserar dock lysogeni!
Fag λ kan bara stoppa in sina gener på specifikt ställe. Det krävs därför att bakteriens DNA innehåller en sekvens som liknar fagens.

HUR KAN FAG λ OCH ANDRA FAGER ANVÄNDAS INOM GENTEKNIKEN?
Jo, genom att fagen kan hantera större gener – upp till 15 000 bp. Fag λ som används för detta är modifierad så att den endast går in i lytisk fas, dvs förstör de E.coli-bakterier som den kommer in i. Då viruset sedan lyserar cellen bildas små plack, man kan därmed skörda de gener man ville klona. I vissa fall förekommer dessutom fager som bär på proteinet GOI kodar för. Vidare har man förståss förstört gener hos viruset som kodar för produktion av infektions-proteiner (vissa replikationsgener).